À primeira vista Cody Banks (Frankie Muniz) é um adolescente comum, que odeia matemática, adora andar de skate e tem problemas para se aproximar de garotas. Porém ele na verdade é um agente junior da CIA, tendo que realizar arriscadas missões em nome da segurança nacional. Numa delas Banks precisa de se aproximar de Natalie (Hilary Duff), uma estudante que é filha do Dr. Connors (Martin Donovan), um cientista que está a desenvolver uma perigosa arma de destruição para uma organização terrorista.