Na segunda parte das aventuras de Beethoven, o nosso herói conhece Missy, a cadela São Bernardo dos seus sonhos. Mas infelizmente terá que separar-se dela por causa de Regina, a dona de Missy, uma mulher terrível que a usa como moeda de troca para resolver o seu divórcio. Missy, Beethoven e os seus cachorros voltarão a reunir-se? E Regina, terá aquilo que merece?