少年ミッキーは、登校途中に突然どこかへと連行されてしまう。そこは、全国から優秀な少年少女を集め、特殊部隊員としての訓練を行なう極秘基地だった。そこで、亡くなったはずの祖父と再会したミッキーは、自分も一流の戦士となるべく厳しい訓練に飛び込んでいく。だがその矢先、世界征服をたくらむ海賊が基地を襲撃、仲間たちが捕らえられてしまった。難を逃れたミッキーたちわずかな訓練生は、仲間と世界を救うため立ち上がる。