20世紀初頭、アマゾン奥地にあるという黄金の古代都市エル・ドラードの存在を信じる探検家のパーシー・フォーセットは、過酷なジャングルや現地の住民の襲撃など、何度も命を危険にさらしながらも探検を繰り返していた。やがて協力的だった仲間や家族も、彼に愛想を尽かしてしまう。それでもフォーセットはアマゾンに強いこだわりを見せ…。