日本統治下の台湾で、日本人女性の志村雅子に恋をした台湾人青年のイェン・ザークン。しかし、彼のもとに召集令状が届き、ザークンは日本の軍医として戦地に向かう一方、雅子は日本への帰国を余儀なくされ、2人は離ればなれの運命に。1949年、上海。負傷兵は台湾へ送られるという話を耳にしたユイ・チェンは、行方不明の恋人を捜すため、約1000人の乗客とともに大型客船・太平輪号に乗り込み台湾へと向かう。