ある日海岸沿いの小さな町に、元気な女のコ、ピッピがやってきて、町はずれの｢ごたごた荘｣で一人暮らしを始めた。１０歳のピッピは、みつあみの髪にソバカス、ツギハギだらけの服に、ぶかぶかの靴。おまけに左右色違いの長ーい靴下。でもピッピはタダモノじゃない。卵や粉を空中に放り投げるだけでパンケーキを作ったり、大の大人を投げ飛ばしたりと不思議なパワーがいっぱい。隣に住むセチングレー一家のトミーとアニカとはお友だちになったが、オトナたちはあまりに自由きままなピッピが気にいらない。ついにオトナたちはピッピを町から追い出すことを決め、それを知ったピッピはトニーとアニカを連れ、リンゴ箱の飛行機で大脱出するが・・・。