23. stoljeće, svemirski brod Enterprise nalazi se na rutinskom zadatku kada admiral James T. Kirk primi hitnu poruku iz svemirskog laboratorija Regula 1. Tajnu napravu zvanu 'Projekt postanak' prisvojio je Kirkov stari neprijatelj Khan, briljantni odmetnik iz 20. stoljeća koji ovu napravu koja predstavlja prijetnju cijelom svemiru kani upotrijebiti u smrtonosnoj igri osvete. Uz pomoć svoje grupe genetski modificiranih superljudi Khan preuzme kontrolu nad jednim federacijskim brodom te krene u potjeru za Enterpriseom, odlučan da ništa ne stane na put njegovu cilju: ubojstvu admirala Kirka… Čak i ako to dovede do općeg uništenja.