En el año 1999, un equipo de científicos de Naciones Unidas en un intento de explotar un nuevo recurso energético en una isla desierta llamada Sansara, abren un portal a otro universo, que desencadena latentes entidades biomecánicas. Tres años más tarde, Takuya Goroza vuelve a la isla de Sansara atraído por una misteriosa petición de la universidad...