为了挽救被毁灭的未来，帕拉杜克斯从未来回到过去并企图改变历史，借着杀死贝卡斯，让战斗怪兽的历史被抹灭，他穿越时空夺走各个时代的最强之龙，其中包括游星的星尘龙。游星借助红龙的力量，也回到了过去，找到了游城十代，并回到童实野市找到了武藤游戏，三代决斗王组合，与帕拉杜克斯决斗，三代决斗王该如何进行一场前所未有的决斗，阻止这场悲剧发生呢？