在这个世界上有一个神秘的镜子反射般的世界。在那里没有所谓的美丽，是骑拉帝纳栖息之处。可是因为帝牙卢卡与帕路奇犽的战斗，时空开始扭曲，反转世界被称为黑色瘴毒的云层给覆盖。看到自己的栖身之所被玷污而震怒的骑拉帝纳，找到了罪魁祸首帝牙卢卡，并打算将其带入反转世界。另一方面，在小智等人跟前出现了样子迷你可爱的神奇宝贝，那是被称为感谢神奇宝贝的洁咪。为了帮助洁咪前往葛拉西蒂亚花花田，以进行被称为“花之传递”的集体迁移，小智一行人和洁咪展开了短暂的冒险旅程。