《太空堡垒卡拉狄加：计划》的剧情讲述的是电视剧中没有交代过的一些事情，故事集中在几个未暴露身份的赛昂人身上，将以赛昂人自己的视角，来阐述赛昂人对人类实施核灭族的动机和观点。赛昂人对十二个殖民地的攻击，未能按计划达到完全灭绝人类的目标。潜伏在卡拉狄加和卡布里卡的赛昂人（Cavils）要完成摧毁人类幸存者的任务。