Under ytan handlar om Sandra Lundgren (Johanna Sällström) som befinner sig i drogträsket i Stockholm och med sig har hon en "dödspolare", Roffe (Mikael Persbrandt). Och när hon väl bestämmer sig för att åka på behandlingshem i Småland, så behöver Roffe en ny kompanjon/flickvän och då tar han kontakt med Sandras lillasyster Jannika istället (Tove Appelqvist). Just när Sandra kommer på bättringsvägen, dras Jannika ner i drogvärlden.