Det fantastiske eventyret fortsetter når kongen plutselig trekker sitt siste åndedrag, og Shrek må legge ut på en ny reise sammen med Eselet og Pus med støvler for å finne en arving til tronen. Hele verdens favorittfigurer er tilbake sammen med den ikke alltid like dyktige magikeren Merlin, raringen Arthur, en gjeng mektige prinsesser og en rekke uventede nykomlinger.