Mia er gift med den suksessfulle skolelederen Frederik, som avsløres i å ha begått et alvorlig underslag. Har han gjort det av egen fri vilje, eller har han blitt rammet av en personlighetsforandring på grunn av en hjernesvulst? Mia forsøker desperat å finne ut hva som har skjedd, og hva slags mann hun egentlig er gift med, og hun vil gjøre alt for å redde sitt ekteskap og sin familie. Men hvis Mias tre lykkeligste år var sammen med Frederik mens han var hjerneskadet, hvem var hun så gift med før? Du Forsvinder er en film om å miste fotfestet, og setter fokus på spørsmålet om vi har en fri vilje eller er stytt av hjernens kjemi.