Pippi, Tommy og Annika får bli med Kaptein Langstrømpe på en reise til Nordpolen. På deres reise møter de sjeldne grønne hvaler, og slemme krypskyttere som prøver å fange hvalene. Pippi og de andre er trukket inn i et eventyr hvor oppdraget er å redde hvalene fra de slemme mennene.