ナノサイズになる人体探査機・ヒポクラテス号に乗り込んだジオとノウ博士。ところが小さくなった“ヒポ号”をピピがうっかりのみ込んだ…!?巨大な歯につぶされそうになりながら猛スピードでピピの体の中に流れ込んだ2人。胃から腸へと向かって脱出するつもりがトラブル続きで脱出不可能、絶体絶命の大ピンチ!!そして突然苦しみ出すピピの身に一体何が…！?ピピとの約束を果たすため、ジオは決死の行動に出る。「必ずピピを救って、サバイバルしてみせる！」