クリスマスイブの午後、大混雑している東京の地下鉄で東京トランスポーテーションレールウェイ（TTR）の最新鋭試験車両クモE4-600（通称『クモ』）が何者かに乗っ取られ地下鉄網を暴走し始めた。警視庁は緊急対策会議を招集、第1級テロの可能性ありと見た捜査一課の室井慎次管理官は、緊急対応メンバーの招集を指示、その司令塔として日本初の犯罪交渉人（ネゴシエーター）、真下正義課長率いる刑事部交渉課準備室CICチームをTTR総合司令室へ急行するよう命じる。