西暦2199年。人類は絶望の淵に立たされていた。 外宇宙から襲来した謎の星間国家＜ガミラス＞による遊星爆弾により地球は壊滅的な被害を負い、人類滅亡までの猶予はわずか1年…。 残された最後の希望、それは、人類初の恒星間航行が可能な宇宙戦艦＜ヤマト＞で、ガミラスの攻撃によって汚染された地球を浄化再生するシステム＜コスモリバースシステム＞を受け取りに行く＜ヤマト計画＞だった…。 人類の命運を懸けた16万8千光年の大航海を追想する。