時は八代将軍・徳川吉宗の世。隻眼隻手の怪剣士・丹下左膳は、ひょんなことから柳生藩主の弟・柳生源三郎が無くしてしまった“こけ猿の壺”を手に入れたことから、源三郎と意気投合。だが、この天下の名宝には、柳生家の秘宝の地図が隠されていた。それをめぐって幕府の陰謀が渦巻く中、やがて大争奪戦が巻き起こり･･･。