ムサシたちがボスを迎えに行く間、森の中に作られたロケット団のひみつ基地で留守番することになったニャース。ボスにいいところを見せたいニャースは、音楽が鳴りだせばポケモンたちが勝手に踊りだしてしまう新発明アイテム“モンスターダンシングボール”を披露するため、ささやきポケモンのゴニョゴニョを捕まえてくる。一方、偶然基地を見つけたピカチュウたちは、捕らわれたゴニョゴニョを助けようとするのだが……。