電脳ネットワーク“SYSTEM”が管理するユートピア“エデンシティ”。天才ハッカーの青年エイジは、シティを統括する情報監督局E＝Xへの入局が認められるエリートだった。その一方、ゲーム会社を装ってSYSTEMの管理に敵対するオレンジ社のレジスタンス活動が始まり、天才ゲーマーでもあるエイジはいつしかその争いに巻き込まれていく。やがてエイジは、シティの支配者とされるウォン・ダイの正体を知る。