パトロール中に遭難者を救助した原子力潜水艦・ユリシーズ。だが、その正体は潜水艦に搭載された核ミサイルを狙うテロリストで、アメリカに核攻撃を仕掛けると脅迫する。潜水艦を設計した元特殊部隊のジェームズ・カーターは、たったひとり潜水艦に侵入する。