ארגון סודי בשם "גברים בשחור" שמטרתו להגן על תושבי כדור הארץ מחייזרים המגיעים לכדור הארץ ולהסתיר את זהותם מקבל איום על המין האנושי בידי זן של חרקים מפותחים. כדי למנוע את השתלטותם של חייזרים אלה מגויס שוטר צעיר לארגון להיות שותף של אחד מותיקי הארגון. עכשיו בתור הגברים בשחור המכונים "ג'יי" ו-"קיי" עליהם להגן על כדור הארץ ולהשמיד את החייזר ובאותו זמן לשמור על זהותם החשאית.