"הלקחנים" גרים מתחת לקורות רצפת העץ באחוזה הממוקמת על גן קסום בפרברי טוקיו. ארייטי הקטנטנה בת ה 14 גרה עם שני הוריה הקטנטנים מוקפים בחפצים קטנטנים. דיירות הבית, שתי נשים זקנות, לא מודעות כלל לקיומם של הדיירים המיניאטורים מתחת לרגליהן. כל חפציהם של ארייטי ומשפחתה "נלקחו בהשאלה" או עשוים מדברים שנלקחו. האוכל והמים, השולחנות והכסאות, כלי המטבח וגם פינוקים פה ושם – קוביית סוכר שנזנחה מאחור, חתיכת בד עודף. אך רק קצת כל פעם כדי שהגברות הזקנות לא תשמנה לב. יום אחד נכנס להתגורר בבית הזקנות ילד בן 12 בשם שו. בניגוד להזהרות החוזרות ונשנות של הוריה, ארייטי הסקרנית לא מתאפקת מלהתבונן בילד ולהתקרב אליו עד שלבסוף היא מתגלה על ידיו. השניים מוצאים זה בזו אוזן קשבת לסודותיהם וחברות אמת מתחילה לפרוח בין בן האנוש ל-"לקחנית" הקטנטנה.