לאחר שהוענק לו כוח מדהים שלא לגמרי מובן לו, סוניק נשלח למחבוא בכדור הארץ וניתן לו חוק אחד: בשום אופן אל תיתן לעולם לדעת שאתה קיים. אך זו לא משימה פשוטה עבור נער בן 15 – במיוחד עם גישה ויכולות כשל סוניק. במהרה הוא מתגלה ע"י טום – שוטר סרקסטי מעיירה קטנה ועם לב גדול. יחד הם יוצאים להרפתקה מדהימה ועמוסה באקשן, כשבעקבותיהם ד"ר רובוטניק המטורף ויצירותיו המכאניות.