Kouji et ses amis ont vaincu le Dr. Hell et profitent maintenant d'une pause, mais soudain un étrange prophète apparaît et prévient tout le monde d'un danger imminent. Des bêtes mécaniques, jamais vues auparavant, commencent à apparaître partout dans le monde et à faire des ravages. C'est à Kouji et à son Mazinger Z de faire face à cette menace, mais il semble qu'il soit largement dépassé en nombre et en qualité.