Después de muchos intentos de destruir Grendizer y conquistar la tierra, el Rey Vega envía al general Barendos y sus tropas en una misión especial. Antes de aterrizar, Barendos se detiene en la base lunar y advierte a los dos oficiales allí que, en caso de éxito, serán despedidos y asesinados. Barendos llega a la tierra y captura al aliado más cercano de Duke Fleed, Koji Kabuto. Mientras estaba bajo control mental en cautiverio, Koji revela la historia y la ubicación tanto de Mazinger Z como de Gran Mazinger. El Imperio Vega aprovechó la oportunidad para capturar al Gran Mazinger y obliga a Duke y su Grendizer a luchar contra el Gran Mazinger. Grendizer y Gran Mazinger se enfrentan en batalla hasta que Grendizer logra desactivar el Gran Mazinger usando un disparo especial, sugerido por Koji.